載體指南
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斑馬魚基因表達(dá)Tol2載體
概述
我們的Tol2載體系統(tǒng)可以非常有效地將外源DNA插入到宿主細(xì)胞的基因組中。該系統(tǒng)技術(shù)簡(jiǎn)單,利用質(zhì)粒轉(zhuǎn)染或電轉(zhuǎn)的方法可將您感興趣的基因永久整合到宿主基因組中。
該系統(tǒng)來源于Tol2轉(zhuǎn)座子,它最初是從硬骨魚青鳉魚(Oryzias latipes)中分離出來的。 基于序列同源性分析,發(fā)現(xiàn)Tol2轉(zhuǎn)座子與整個(gè)脊椎動(dòng)物基因組中發(fā)現(xiàn)的非自主元件的hAT家族密切相關(guān)。
Tol2系統(tǒng)包含兩個(gè)載體,一個(gè)載體被稱為輔助質(zhì)粒,負(fù)責(zé)編碼轉(zhuǎn)座酶;另一個(gè)載體被稱為轉(zhuǎn)座子質(zhì)粒,包含兩個(gè)反向末端重復(fù)序列(ITRs)以及兩者之間的轉(zhuǎn)座區(qū)域,需要被轉(zhuǎn)座到宿主基因組中的目的基因就克隆在這個(gè)區(qū)域。
當(dāng)輔助質(zhì)粒和轉(zhuǎn)座子質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染靶細(xì)胞時(shí),輔助質(zhì)粒產(chǎn)生的轉(zhuǎn)座酶將會(huì)識(shí)別轉(zhuǎn)座子的兩個(gè)ITR,然后將被轉(zhuǎn)座區(qū)和兩個(gè)ITR元件插入到宿主基因組中。Tol2轉(zhuǎn)座子在宿主細(xì)胞中的插入位點(diǎn)沒有明顯堿基偏好性,這不同于具有特定靶標(biāo)位點(diǎn)的轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)。如,piggyBac轉(zhuǎn)座插入通常發(fā)生在包含TTAA序列的宿主染色體位點(diǎn)。
Tol2是II類轉(zhuǎn)座子,通過“剪切—粘貼”的機(jī)制移動(dòng),從一個(gè)地方轉(zhuǎn)座到另一個(gè)地方,而不留下序列本身(恰好相反,I類轉(zhuǎn)座子是通過“復(fù)制—粘貼”的方式移動(dòng))。Tol2通過“剪切-粘貼”機(jī)制以單拷貝進(jìn)行整合,在每一個(gè)插入位點(diǎn)都會(huì)產(chǎn)生一個(gè)8 bp的重復(fù)序列。
有兩種途徑可將轉(zhuǎn)座酶導(dǎo)入靶細(xì)胞。第一種是將輔助質(zhì)粒瞬時(shí)轉(zhuǎn)染到細(xì)胞中,使轉(zhuǎn)座酶的瞬時(shí)表達(dá)。 第二種是利用輔助質(zhì)粒體外轉(zhuǎn)錄出Tol2 mRNA,然后注射到靶細(xì)胞中。無論哪種情況,轉(zhuǎn)座酶都只能短時(shí)間表達(dá)。 隨著輔助質(zhì)粒的丟失或轉(zhuǎn)座酶mRNA的降解,轉(zhuǎn)座子會(huì)永久整合到宿主基因組中。如果將Tol2轉(zhuǎn)座酶重新導(dǎo)入細(xì)胞中,整合的轉(zhuǎn)座子會(huì)再次通過“剪切—粘貼”的機(jī)制移動(dòng)。
關(guān)于該載體系統(tǒng)的更多信息,請(qǐng)參考以下文獻(xiàn)。
參考文獻(xiàn) | 主題 |
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Genome Biol. 8(Suppl 1): S7 (2007) | Review of Tol2 vectors. |
Genetics 174: 639 (2006) | Identification of minimal sequences for Tol2 transposable elements. |
PLoS Genetics 2: e169 (2006) | Large cargo-capacity transposition with a minimal Tol2 transposon. |
亮點(diǎn)
Tol2轉(zhuǎn)座子載體系統(tǒng)可將高達(dá)11 kb的序列有效插入到靶細(xì)胞基因組中。我們的Tol2轉(zhuǎn)座子載體與輔助質(zhì)粒是經(jīng)過優(yōu)化的,可在大腸桿菌中高拷貝復(fù)制。該載體系統(tǒng)對(duì)多種類型的靶細(xì)胞均具有高效的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率,實(shí)現(xiàn)外源基因的高水平表達(dá)。
優(yōu)勢(shì)
外源基因的永久整合:常規(guī)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染只能實(shí)現(xiàn)外源基因的瞬時(shí)表達(dá),這種外源基因會(huì)隨著宿主細(xì)胞的分裂而不斷丟失,在快速分裂的細(xì)胞中顯得尤為顯著。相反,將Tol2轉(zhuǎn)座子載體和輔助質(zhì)粒(或者Tol2 mRNA)一起轉(zhuǎn)染到哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,由于轉(zhuǎn)座子在轉(zhuǎn)座酶的作用下,目的基因能穩(wěn)定地整合到宿主細(xì)胞的染色體中,從而實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子載體上攜帶的目的基因在宿主細(xì)胞中永久表達(dá)。
技術(shù)簡(jiǎn)單:通過常規(guī)轉(zhuǎn)染即可把質(zhì)粒轉(zhuǎn)入細(xì)胞,相比起病毒載體需要進(jìn)行病毒包裝,過程更簡(jiǎn)單。
載體容量大:我們的轉(zhuǎn)座子載體總?cè)萘靠蛇_(dá)11 kb,其中質(zhì)粒骨架只占3 kb,有足夠大的容量可以放置客戶所感興趣的序列。
轉(zhuǎn)染細(xì)胞類型受限:Tol2載體進(jìn)入細(xì)胞依賴于轉(zhuǎn)染。不同類型的細(xì)胞,其轉(zhuǎn)染效率差異非常大。非分裂細(xì)胞通常比分裂細(xì)胞更難轉(zhuǎn)染,原代細(xì)胞比永生化細(xì)胞更難轉(zhuǎn)染,一些重要的細(xì)胞類型轉(zhuǎn)染難度更大,如神經(jīng)元和胰島β細(xì)胞。另外,質(zhì)粒轉(zhuǎn)染主要局限于體外應(yīng)用,很少應(yīng)用于體內(nèi)實(shí)驗(yàn)(但可以應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因動(dòng)物模型制備)。以上因素在一定程度上制約了Tol2系統(tǒng)的應(yīng)用。
載體關(guān)鍵元件
5' ITR: Tol2 5' terminal repeat. When a DNA sequence is flanked by two ITRs, the Tol2 transposase can recognize them, and insert the flanked region including the two ITRs into the host genome.
Promoter: The promoter driving your gene of interest is placed here.
Kozak: Kozak consensus sequence. This is placed in front of the start codon of the ORF of interest to facilitate translation initiation in eukaryotes.
ORF: The open reading frame of your gene of interest is placed here.
SV40 late pA: Simian virus 40 late polyadenylation signal. It facilitates transcriptional termination of the upstream ORF.
3' ITR: Tol2 3' terminal repeat. When a DNA sequence is flanked by two ITRs, the Tol2 transposase can recognize them, and insert the flanked region including the two ITRs into the host genome.
Ampicillin: Ampicillin resistance gene. It allows the plasmid to be maintained by ampicillin selection in E. coli.
pUC ori: pUC origin of replication. Plasmids carrying this origin exist in high copy numbers in E. coli.